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國立臺灣大學 海洋研究所 單偉彌所指導 蕭菀謙的 北台灣底棲群聚與環境因子間的關聯 （2019），提出AD15R關鍵因素是什麼，來自於底棲群聚、環境因子、非監督式學習、監督式學習、生態系。

而第二篇論文國立中興大學 獸醫學系暨研究所 郭致榮所指導 許文金的 探討半胱胺酸蛋白酶功能區對於困難梭狀桿菌毒素 B 之毒力影響 （2018），提出因為有 困難梭狀桿菌、高毒力株、毒素 B 半胱胺酸蛋白酶功能區、自體蛋白水解、體外水解的重點而找出了 AD15R的解答。

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北台灣底棲群聚與環境因子間的關聯

為了解決AD15R的問題，作者蕭菀謙 這樣論述：

全球環境尺度下,人為活動及氣候變遷對熱帶珊瑚礁生態系的未來造成莫大的影響。區域環境尺度下,周遭環境使得不同群聚間存在些微的差異,因此對於環境的改變也有不同的靈敏度。儘管非生物性環境因子對於這些群聚有重要意義, 但先前的研究多著重於相變而忽略了環境因子在小尺度範圍下的影響。本研究目的為探討不同底棲群聚與其對應的環境條件(如:物理、化學、及地質因子)之間的關係,並探討群聚組成會受哪些決定性環境因子影響。實驗地點為台灣東北角10個樣點(5個地點X 2個深度)以形態功能群(morpho-functional group)為區分方式進行底棲群聚調查及周遭環境因子資料蒐集。藉由兩種方法,(1)非監督式k

均質集群分析(Unsupervised k-means clustering) 和 (2)監督式多變項回歸樹分析 (Supervised Multivariate Regression Tree, MRT)探討決定性環境因子與底棲群聚之間的關聯,並比較兩種方法的差異性和檢驗非監督式k均質集群分析對於環境因子的預測力是否準確 。研究結果顯示殼狀珊瑚藻 (Crustose coralline algae, CCA) 在本研究實驗地點中有約一半的覆蓋率,為東北角相對優勢的形態功能群。其他形態功能群在實驗地點間擁有較大的標準差, 表示在各個樣點有不同的覆蓋率。化學因子在深度以及地點間並無明顯的差異,波

浪(wave motion)強度及底質的不同在兩種分析方法中解釋了大部分的群聚差異,可視為東北角的決定性環境因子。MRT 和 k-means 的分群結果獲得0.82的調整蘭德指數 (Adjusted Rand Index),顯示兩種分析方法所獲得的結果有高度的相似性,也間接證實了非監督式學習方法對於相對應環境因子的高度預測能力。本研究所獲得的結論除了能夠評估未來群聚潛在的動態變化之外, 也可以對海洋沿岸底棲群聚的保育及管理有所幫助。

探討半胱胺酸蛋白酶功能區對於困難梭狀桿菌毒素 B 之毒力影響

為了解決AD15R的問題，作者許文金 這樣論述：

困難梭狀桿菌之毒素 A (TcdA) 及毒素B (TcdB)，是困難梭狀桿菌疾病致病的主要因素，由tcdA 與 tcdB 負責表達，該疾病通常與抗生素所造成的院內腹瀉相關。先前的研究發現TcdB 是決定困難梭狀桿菌感染病的重要因子。TcdA 及 TcdB 分別由 2710 及2366 胺基酸所組成，均有四個功能區域，分別是 glucosyltransfera-ses domain (GTD)、cysteine protease domain (CPD)、translocation domain (TD)、combined repetitive oligopeptides (CROPs)。CP

D 在 TcdB 自體蛋白水解過程中具有決定性的作用，通過自體蛋白水解的方式將GTD 水解並釋放到胞質溶膠細胞質中，GTD抑制Rho GTPase 使其失去活性，而引起細胞骨架受到破壞，最終導致細胞死亡。先前的研究提出，TcdB蛋白質序列之變異可能是高毒力株困難梭狀桿菌致病嚴重程度之重要決定因素。本實驗針對十一個來自高毒力株及一般菌株的TcdB CPD之自體蛋白水解活性進行研究。根據本實驗的蛋白質序列比對結果顯示，ribotype (RT) 012 (630)、RT 001 (ATCC9689)、RT 002 (TNHP20)、 RT 014 (TNHP68) 和 RT087 (ATCC432

55) 並無差異。然而，屬於高毒力株的 RT 017 (TNHP82)，RT 027 (R20291) 及 RT 078 lineage胺基酸序列均有突變之現象，與一般菌株的胺基酸序列相似性百分比為 90.56 %、97.24 %、96.85 %。不僅如此，在體外水解活性試驗顯示，RT 017 (TNHP82) 和 RT 078 lineage在相同條件下，其自體蛋白水解活性更是比一般菌株來得高。 其中 RT 017 (TNHP82) 的自體蛋白水解活性rate為 0.94 μg/min， RT 078 lineage的自體蛋白水解活性rate 為0.16 μg/min，而一般菌株的自體蛋白水

解活性rate 僅 0.07 μg/min。值得注意的是，RT 027 (20291) 具有最高的自體蛋白水解活性，該結果顯示於重組蛋白質純化結果。綜上所述，TcdB CPD 胺基酸之突變可影響並導致高毒力株和一般菌株之間自體蛋白水解速率差異。

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